Shrinkwrap permite crear archivos JARs, WARs y EARs desde Java.
(Si me hubiérais preguntando hace unos meses hubiera dicho que con Ant y Maven esto estaba superado, pero ahora mismo le veo mucha utilidad)
Este ejemplo muestra cómo se usa:
Y como generar un WAR (comprimido o descomprimido):
La documentación y los ejemplos se encuentran en su Wiki
Un poco de Java 
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